Izvršni odbor priprema i sprovodi stavove Glavnog odbora, donosi odluke o sindikalnim, ekonomsko-socijalnim i finansijskim pitanjima od interesa za organizaciju, koordinira aktivnosti granskih sindikata, imenuje regionalne poverenike i koordinatore, predstavnike i bipartitna i tripartitna tela na nacionalnom nivou, glavnog i odgovornog urednika sajta, elektronskih i štampanih izdanja, daje saglasnost za zaključivanje Opšteg i posebnih kolektivnih ugovora, daje saglasnost za organizovanje štajkova granskih sindikata, sprovodi finansijski plan, usvaja izveštaje popisnih komisija i sl.
Izvršni odbor UGS NEZAVISNOST čine, predsednik/ca, zamenik predsednika/ce, potpredsednici/ice, izvršni sektratar/ka UGS NEZAVISNOST i predsednici granskih sindikata.